La SAFNA est née de la volonté de deux résidents en neurochirurgie, le Dr Nourou Dine BANKOLE et le Dr Hugues DOKPONOU. Leur but était de partager des connaissances en plein Covid (année 2020), une période assez difficile où les rencontres physiques étaient impossibles. Il était également très important pour eux de continuer à motiver les résidents à faire plus d’effort malgré la morosité des temps, mais aussi de participer à susciter l’intérêt de cette spécialité auprès des jeunes médecins. Tout au début, cette association se prénommait BETONA (Bénin Togo Neurosurgeons Association). Cette dénomination avait suscité une vive polémique du fait qu’elle n’avait en ce moment aucun neurochirurgien en son sein. Par la suite, avec l’évolution et l’intérêt manifeste de beaucoup d’autres médecins de la sous région pour le projet, un nouveau nom plus associateur, plus inclusif pour tout le monde a été trouvé: celà constitue l’origine du nom SAFNA.

Au fil des années, la volonté  associative de la SAFNA  de créer une grande communauté scientifique est devenue plus ferme, plus tenace et s’est matérialisée par diverses réalisations.